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Structure of a Fully assembled T-Cell Receptor Engaging a Tumor-associated Peptide-MHC I
| Item | Info |
|---|---|
| PDB | 7phr |
| Organism | HOMO SAPIENS |
| Method | ELECTRON MICROSCOPY |
| Resolution | NA |
| Number of TCRs | 1 |
This PDB has 1 TCR(s).
| Item | Info |
|---|---|
| VB chain | B |
| VA chain | A |
| VB IMGT details | TRBV19/TRBJ2 |
| VA IMGT details | TRAV17/TRAJ14 |
| Species | human |
| Item | Info |
|---|---|
| Antigen Chain | P |
| Antigen Type | Peptide |
| Antigen Organism | HOMO SAPIENS |
| Antigen Sequence | YLEPGPVTV |
| Antigen Length | 9 |
| Item | Info |
|---|---|
| MHC Chain | H | L |
| MHC Type | MH1 |
| MHC Species | human |
| MHC IMGT details | HLA-A*0201 |
| Chain type | Chain ID | FASTA/Annotation file | IMGT numbered sequence (Framework/CDR) | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| VB | B | FASTA file |
|
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| VA | A | FASTA file |
|
| Loop | Sequence | Predicted canonical form | CDR Length |
|---|---|---|---|
| CDRB3 | ASSWGAPYEQY | None | 11 |
| CDRB2 | SWAQGD | None | 6 |
| CDRB1 | LNHDA | None | 5 |
| CDRA3 | ATDGSTPMQ | None | 9 |
| CDRA2 | IRSNERE | None | 7 |
| CDRA1 | TSINN | None | 5 |
| Angle | Value |
|---|---|
| BC2 | 102.84° |
| BC1 | 68.79° |
| BA | -60.97° |
| AC2 | 80.25° |
| AC1 | 128.63° |
| dc | 16.90Å |
| Docking angle | 43.77° |
| TCR PDB | BC2 | BC1 | BA | AC2 | AC1 | dc | TRangle Distance |
|---|---|---|---|---|---|---|---|
| 3tpu_HG | 104.60° | 69.86° | -61.37° | 80.13° | 129.21° | 17.65Å | 2.3 |
| 3tpu_BA | 104.73° | 70.40° | -61.30° | 80.06° | 128.52° | 17.68Å | 2.6 |
| 3tpu_DC | 105.89° | 70.23° | -62.13° | 79.88° | 129.22° | 17.56Å | 3.7 |
| 7zt8_ED | 102.98° | 70.77° | -62.30° | 81.33° | 125.87° | 16.92Å | 3.8 |
| 3tpu_NM | 106.04° | 70.98° | -62.06° | 80.38° | 128.83° | 17.57Å | 4.1 |