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MHC Class I a02 allele Presenting Lllgigilvl, in complex with Mel5 TCR
Item | Info |
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PDB | 7q9a |
Organism | HOMO SAPIENS |
Method | X-RAY DIFFRACTION |
Resolution | 2.1Å |
Number of TCRs | 1 |
This PDB has 1 TCR(s).
Item | Info |
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VB chain | E |
VA chain | D |
VB IMGT details | TRBV30/TRBJ2 |
VA IMGT details | TRAV12/TRAJ27 |
Species | human |
Item | Info |
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Antigen Chain | C |
Antigen Type | Peptide |
Antigen Organism | HOMO SAPIENS |
Antigen Sequence | LLLGIGILVL |
Antigen Length | 10 |
Item | Info |
---|---|
MHC Chain | A | B |
MHC Type | MH1 |
MHC Species | human |
MHC IMGT details | HLA-A*0201 |
Chain type | Chain ID | FASTA/Annotation file | IMGT numbered sequence (Framework/CDR) | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
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VB | E | FASTA file |
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VA | D | FASTA file |
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Loop | Sequence | Predicted canonical form | CDR Length |
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CDRB3 | AWSETGLGTGELF | None | 13 |
CDRB2 | SVGIG | None | 5 |
CDRB1 | GTSNPN | None | 6 |
CDRA3 | AVNVAGKST | None | 9 |
CDRA2 | IYSNGD | None | 6 |
CDRA1 | DRGSQS | None | 6 |
Angle | Value |
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BC2 | 102.66° |
BC1 | 75.50° |
BA | -56.57° |
AC2 | 81.42° |
AC1 | 123.12° |
dc | 15.86Å |
Docking angle | 48.39° |
TCR PDB | BC2 | BC1 | BA | AC2 | AC1 | dc | TRangle Distance |
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3hg1_ED | 102.96° | 75.98° | -56.36° | 81.48° | 122.11° | 15.76Å | 1.2 |
4qok_ED | 102.00° | 76.45° | -57.56° | 81.92° | 122.13° | 15.75Å | 1.9 |
6eqa_ED | 103.53° | 76.42° | -57.80° | 80.53° | 122.62° | 15.68Å | 2.0 |
8gop_BA | 103.32° | 74.63° | -57.79° | 80.90° | 124.46° | 16.51Å | 2.3 |
7q99_ED | 103.40° | 75.70° | -58.23° | 80.04° | 122.68° | 15.69Å | 2.3 |
Antibody PDB | HC2 | HC1 | HL | LC2 | LC1 | dc | ABangle Distance |
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3mnw_BA | 107.15° | 71.13° | -53.34° | 82.80° | 121.51° | 16.47Å | 7.4 |
4yfl_HL | 109.78° | 73.75° | -56.79° | 79.59° | 122.71° | 16.13Å | 7.6 |
3mnz_BA | 108.41° | 71.26° | -53.27° | 82.05° | 121.70° | 16.38Å | 8.0 |
3bgf_BC | 109.96° | 71.90° | -55.10° | 81.62° | 123.51° | 15.76Å | 8.3 |
3mnv_DC | 108.94° | 70.99° | -55.77° | 82.75° | 119.97° | 16.56Å | 8.5 |