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W316 TCR in complex with HLA-Dq2-Omega1
Item | Info |
---|---|
PDB | 7sg0 |
Organism | HOMO SAPIENS |
Method | X-RAY DIFFRACTION |
Resolution | 3Å |
Number of TCRs | 1 |
This PDB has 1 TCR(s).
Item | Info |
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VB chain | E |
VA chain | D |
VB IMGT details | TRBV7/TRBJ1 |
VA IMGT details | TRAV9/TRAJ52 |
Species | human |
Item | Info |
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Antigen Chain | C |
Antigen Type | Peptide |
Antigen Organism | HOMO SAPIENS |
Antigen Sequence | QPFPQPEQPFP |
Antigen Length | 11 |
Item | Info |
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MHC Chain | B | NA |
MHC Type | GB |
MHC Species | human |
Chain type | Chain ID | FASTA/Annotation file | IMGT numbered sequence (Framework/CDR) | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
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VB | E | FASTA file |
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VA | D | FASTA file |
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Loop | Sequence | Predicted canonical form | CDR Length |
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CDRB3 | ASSQGQDTEAF | None | 11 |
CDRB2 | FQGTGA | None | 6 |
CDRB1 | SGHTA | None | 5 |
CDRA3 | ALSGGTSYGKLT | None | 12 |
CDRA2 | ATKADDK | None | 7 |
CDRA1 | ATGYPS | None | 6 |
Angle | Value |
---|---|
BC2 | 102.38° |
BC1 | 77.02° |
BA | -65.64° |
AC2 | 74.45° |
AC1 | 120.37° |
dc | 16.11Å |
TCR PDB | BC2 | BC1 | BA | AC2 | AC1 | dc | TRangle Distance |
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6u3n_ED | 103.98° | 77.40° | -64.24° | 76.66° | 120.29° | 15.78Å | 3.1 |
8cx4_FD | 104.29° | 75.46° | -65.22° | 77.54° | 119.22° | 15.63Å | 4.2 |
5eu6_ED | 103.65° | 79.06° | -68.37° | 72.34° | 119.45° | 15.81Å | 4.3 |
6v0y_ED | 104.44° | 74.25° | -66.45° | 75.16° | 118.10° | 16.73Å | 4.3 |
6v1a_ED | 105.38° | 74.47° | -66.72° | 75.16° | 119.27° | 16.59Å | 4.3 |
Antibody PDB | HC2 | HC1 | HL | LC2 | LC1 | dc | ABangle Distance |
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4yfl_FI | 106.92° | 71.36° | -64.48° | 73.60° | 120.95° | 15.85Å | 7.4 |
1n4x_IM | 107.07° | 73.94° | -70.53° | 72.40° | 121.78° | 15.58Å | 7.9 |
5jue_HL | 106.42° | 70.98° | -68.16° | 76.41° | 119.66° | 16.06Å | 8.0 |
4uim_CD | 109.21° | 71.18° | -68.12° | 75.36° | 117.53° | 16.19Å | 9.8 |
4y5x_DE | 111.23° | 74.78° | -66.04° | 76.13° | 117.27° | 15.67Å | 9.8 |