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W316 TCR in complex with HLA-Dq2-Omega1
| Item | Info |
|---|---|
| PDB | 7sg0 |
| Organism | HOMO SAPIENS |
| Method | X-RAY DIFFRACTION |
| Resolution | 3Å |
| Number of TCRs | 1 |
This PDB has 1 TCR(s).
| Item | Info |
|---|---|
| VB chain | E |
| VA chain | D |
| VB IMGT details | TRBV7/TRBJ1 |
| VA IMGT details | TRAV9/TRAJ52 |
| Species | human |
| Item | Info |
|---|---|
| Antigen Chain | C |
| Antigen Type | Peptide |
| Antigen Organism | HOMO SAPIENS |
| Antigen Sequence | QPFPQPEQPFP |
| Antigen Length | 11 |
| Item | Info |
|---|---|
| MHC Chain | B | NA |
| MHC Type | GB |
| MHC Species | human |
| Chain type | Chain ID | FASTA/Annotation file | IMGT numbered sequence (Framework/CDR) | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| VB | E | FASTA file |
|
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| VA | D | FASTA file |
|
| Loop | Sequence | Predicted canonical form | CDR Length |
|---|---|---|---|
| CDRB3 | ASSQGQDTEAF | None | 11 |
| CDRB2 | FQGTGA | None | 6 |
| CDRB1 | SGHTA | None | 5 |
| CDRA3 | ALSGGTSYGKLT | None | 12 |
| CDRA2 | ATKADDK | None | 7 |
| CDRA1 | ATGYPS | None | 6 |
| Angle | Value |
|---|---|
| BC2 | 102.38° |
| BC1 | 77.02° |
| BA | -65.64° |
| AC2 | 74.45° |
| AC1 | 120.37° |
| dc | 16.11Å |
| TCR PDB | BC2 | BC1 | BA | AC2 | AC1 | dc | TRangle Distance |
|---|---|---|---|---|---|---|---|
| 6u3n_ED | 103.98° | 77.40° | -64.24° | 76.66° | 120.29° | 15.78Å | 3.1 |
| 8cx4_FD | 104.29° | 75.46° | -65.22° | 77.54° | 119.22° | 15.63Å | 4.2 |
| 5eu6_ED | 103.65° | 79.06° | -68.37° | 72.34° | 119.45° | 15.81Å | 4.3 |
| 6v0y_ED | 104.44° | 74.25° | -66.45° | 75.16° | 118.10° | 16.73Å | 4.3 |
| 6v1a_ED | 105.38° | 74.47° | -66.72° | 75.16° | 119.27° | 16.59Å | 4.3 |
| Antibody PDB | HC2 | HC1 | HL | LC2 | LC1 | dc | ABangle Distance |
|---|---|---|---|---|---|---|---|
| 4yfl_FI | 106.92° | 71.36° | -64.48° | 73.60° | 120.95° | 15.85Å | 7.4 |
| 1n4x_IM | 107.07° | 73.94° | -70.53° | 72.40° | 121.78° | 15.58Å | 7.9 |
| 5jue_HL | 106.42° | 70.98° | -68.16° | 76.41° | 119.66° | 16.06Å | 8.0 |
| 4uim_CD | 109.21° | 71.18° | -68.12° | 75.36° | 117.53° | 16.19Å | 9.8 |
| 4y5x_DE | 111.23° | 74.78° | -66.04° | 76.13° | 117.27° | 15.67Å | 9.8 |