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Structure of E8 TCR in complex in Human Mr1 Bound to 3Fsa
Item | Info |
---|---|
PDB | 7zt5 |
Organism | HOMO SAPIENS |
Method | X-RAY DIFFRACTION |
Resolution | 2.09Å |
Number of TCRs | 1 |
This PDB has 1 TCR(s).
Item | Info |
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VB chain | E |
VA chain | D |
VB IMGT details | TRBV6/TRBJ1 |
VA IMGT details | TRAV1/TRAJ33 |
Species | human |
Item | Info |
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MHC Chain | A | B |
MHC Type | MR1 |
MHC Species | human |
MHC IMGT details | MR1*01 |
Chain type | Chain ID | FASTA/Annotation file | IMGT numbered sequence (Framework/CDR) | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
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VB | E | FASTA file |
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VA | D | FASTA file |
|
Loop | Sequence | Predicted canonical form | CDR Length |
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CDRB3 | ASSNREYSPLH | None | 11 |
CDRB2 | SASEGT | None | 6 |
CDRB1 | MNHNY | None | 5 |
CDRA3 | AFLDSNYQLI | None | 10 |
CDRA2 | NVLDGL | None | 6 |
CDRA1 | TSGFNG | A1-6-F | 6 |
Angle | Value |
---|---|
BC2 | 103.23° |
BC1 | 72.34° |
BA | -63.43° |
AC2 | 79.07° |
AC1 | 124.43° |
dc | 16.59Å |
Docking angle | 59.88° |
TCR PDB | BC2 | BC1 | BA | AC2 | AC1 | dc | TRangle Distance |
---|---|---|---|---|---|---|---|
7zt4_ED | 103.15° | 72.15° | -63.39° | 79.15° | 124.46° | 16.62Å | 0.2 |
7zt7_ED | 103.17° | 72.09° | -63.37° | 78.78° | 124.55° | 16.63Å | 0.4 |
7zt2_ED | 103.28° | 71.69° | -63.23° | 78.73° | 124.60° | 16.68Å | 0.8 |
7zt9_ED | 103.29° | 71.54° | -62.82° | 79.46° | 124.99° | 16.64Å | 1.2 |
4pja_HG | 104.00° | 72.79° | -63.36° | 79.29° | 123.58° | 16.70Å | 1.3 |
Antibody PDB | HC2 | HC1 | HL | LC2 | LC1 | dc | ABangle Distance |
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4dcq_BA | 108.30° | 73.42° | -64.76° | 82.94° | 120.98° | 16.23Å | 7.5 |
3s96_AB | 107.61° | 73.57° | -66.51° | 82.70° | 120.78° | 16.43Å | 7.5 |
4yfl_FI | 106.92° | 71.36° | -64.48° | 73.60° | 120.95° | 15.85Å | 7.6 |
1nmc_HL | 110.09° | 71.80° | -64.06° | 80.19° | 120.88° | 16.16Å | 7.9 |
5jue_HL | 106.42° | 70.98° | -68.16° | 76.41° | 119.66° | 16.06Å | 8.0 |