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Cryoem Structure of Pn45428 TCR-Cd3 in complex with HLA-A2 Magea4
Item | Info |
---|---|
PDB | 8es9 |
Organism | HOMO SAPIENS |
Method | ELECTRON MICROSCOPY |
Resolution | NA |
Number of TCRs | 1 |
This PDB has 1 TCR(s).
Item | Info |
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VB chain | B |
VA chain | A |
VB IMGT details | TRBV20/TRBJ1 |
VA IMGT details | TRAV20/TRAJ38 |
Species | human |
Item | Info |
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Antigen Chain | P |
Antigen Type | Peptide |
Antigen Organism | HOMO SAPIENS |
Antigen Sequence | GVYDGREHTV |
Antigen Length | 10 |
Item | Info |
---|---|
MHC Chain | N | M |
MHC Type | MH1 |
MHC Species | human |
MHC IMGT details | HLA-A*0201 |
Chain type | Chain ID | FASTA/Annotation file | IMGT numbered sequence (Framework/CDR) | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
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VB | B | FASTA file |
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VA | A | FASTA file |
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Loop | Sequence | Predicted canonical form | CDR Length |
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CDRB3 | SAREWGGTEAF | None | 11 |
CDRB2 | SNEGSKA | None | 7 |
CDRB1 | DFQATT | None | 6 |
CDRA3 | AVQPLNAGNNRKLI | None | 14 |
CDRA2 | LYSAGEE | None | 7 |
CDRA1 | VSGLRG | None | 6 |
Angle | Value |
---|---|
BC2 | 99.43° |
BC1 | 67.31° |
BA | -47.86° |
AC2 | 87.02° |
AC1 | 128.97° |
dc | 18.02Å |
Docking angle | 84.86° |
TCR PDB | BC2 | BC1 | BA | AC2 | AC1 | dc | TRangle Distance |
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2iam_DC | 100.10° | 66.38° | -46.77° | 85.29° | 127.34° | 16.86Å | 3.1 |
2ian_ON | 100.39° | 65.95° | -46.45° | 85.10° | 127.80° | 16.91Å | 3.3 |
2ian_TS | 100.53° | 65.98° | -47.12° | 84.53° | 127.43° | 16.86Å | 3.7 |
8en8_JI | 99.10° | 66.80° | -45.73° | 83.58° | 129.37° | 17.46Å | 4.1 |
8enh_TS | 98.70° | 66.39° | -46.25° | 82.78° | 129.52° | 17.52Å | 4.7 |