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Cryoem Structure of Pn45428 TCR-Cd3 in complex with HLA-A2 Magea4
| Item | Info |
|---|---|
| PDB | 8es9 |
| Organism | HOMO SAPIENS |
| Method | ELECTRON MICROSCOPY |
| Resolution | NA |
| Number of TCRs | 1 |
This PDB has 1 TCR(s).
| Item | Info |
|---|---|
| VB chain | B |
| VA chain | A |
| VB IMGT details | TRBV20/TRBJ1 |
| VA IMGT details | TRAV20/TRAJ38 |
| Species | human |
| Item | Info |
|---|---|
| Antigen Chain | P |
| Antigen Type | Peptide |
| Antigen Organism | HOMO SAPIENS |
| Antigen Sequence | GVYDGREHTV |
| Antigen Length | 10 |
| Item | Info |
|---|---|
| MHC Chain | N | M |
| MHC Type | MH1 |
| MHC Species | human |
| MHC IMGT details | HLA-A*0201 |
| Chain type | Chain ID | FASTA/Annotation file | IMGT numbered sequence (Framework/CDR) | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
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| VB | B | FASTA file |
|
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| VA | A | FASTA file |
|
| Loop | Sequence | Predicted canonical form | CDR Length |
|---|---|---|---|
| CDRB3 | SAREWGGTEAF | None | 11 |
| CDRB2 | SNEGSKA | None | 7 |
| CDRB1 | DFQATT | None | 6 |
| CDRA3 | AVQPLNAGNNRKLI | None | 14 |
| CDRA2 | LYSAGEE | None | 7 |
| CDRA1 | VSGLRG | None | 6 |
| Angle | Value |
|---|---|
| BC2 | 99.43° |
| BC1 | 67.31° |
| BA | -47.86° |
| AC2 | 87.02° |
| AC1 | 128.97° |
| dc | 18.02Å |
| Docking angle | 84.86° |
| TCR PDB | BC2 | BC1 | BA | AC2 | AC1 | dc | TRangle Distance |
|---|---|---|---|---|---|---|---|
| 2iam_DC | 100.10° | 66.38° | -46.77° | 85.29° | 127.34° | 16.86Å | 3.1 |
| 2ian_ON | 100.39° | 65.95° | -46.45° | 85.10° | 127.80° | 16.91Å | 3.3 |
| 2ian_TS | 100.53° | 65.98° | -47.12° | 84.53° | 127.43° | 16.86Å | 3.7 |
| 8en8_JI | 99.10° | 66.80° | -45.73° | 83.58° | 129.37° | 17.46Å | 4.1 |
| 8enh_TS | 98.70° | 66.39° | -46.25° | 82.78° | 129.52° | 17.52Å | 4.7 |