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Crystal Structure of a TCR in complex with HLA-A*11:01 Bound to Kras Peptide (Vvgavgvgk)
Item | Info |
---|---|
PDB | 8i5d |
Organism | MUS MUSCULUS |
Method | X-RAY DIFFRACTION |
Resolution | 3.3Å |
Number of TCRs | 1 |
This PDB has 1 TCR(s).
Item | Info |
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VB chain | B |
VA chain | A |
VB IMGT details | TRBV16/TRBJ2 |
VA IMGT details | TRAV8/TRAJ22 |
Species | mouse |
Item | Info |
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Antigen Chain | P |
Antigen Type | Peptide |
Antigen Organism | HOMO SAPIENS |
Antigen Sequence | VVGAVGVGK |
Antigen Length | 9 |
Item | Info |
---|---|
MHC Chain | H | L |
MHC Type | MH1 |
MHC Species | human |
MHC IMGT details | HLA-A*1101 |
Chain type | Chain ID | FASTA/Annotation file | IMGT numbered sequence (Framework/CDR) | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
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VB | B | FASTA file |
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VA | A | FASTA file |
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Loop | Sequence | Predicted canonical form | CDR Length |
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CDRB3 | ASSLEGTVEETLY | None | 13 |
CDRB2 | FRNQAP | None | 6 |
CDRB1 | SGHSA | None | 5 |
CDRA3 | AASSGSWQLI | None | 10 |
CDRA2 | IRSNERE | None | 7 |
CDRA1 | TSITA | None | 5 |
Angle | Value |
---|---|
BC2 | 105.56° |
BC1 | 71.73° |
BA | -65.25° |
AC2 | 81.36° |
AC1 | 126.32° |
dc | 16.74Å |
Docking angle | 45.34° |
TCR PDB | BC2 | BC1 | BA | AC2 | AC1 | dc | TRangle Distance |
---|---|---|---|---|---|---|---|
8vz8_DC | 105.58° | 71.75° | -65.27° | 80.76° | 124.60° | 16.54Å | 1.8 |
4z7w_HG | 105.17° | 72.54° | -64.75° | 79.67° | 126.96° | 16.95Å | 2.1 |
8vz9_DC | 106.18° | 72.14° | -63.32° | 81.74° | 125.40° | 16.62Å | 2.3 |
4z7w_FE | 104.51° | 72.44° | -65.42° | 79.27° | 127.25° | 16.80Å | 2.6 |
4elk_BA | 105.77° | 71.69° | -67.56° | 81.33° | 124.76° | 16.38Å | 2.8 |
Antibody PDB | HC2 | HC1 | HL | LC2 | LC1 | dc | ABangle Distance |
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3s96_AB | 107.61° | 73.57° | -66.51° | 82.70° | 120.78° | 16.43Å | 6.5 |
4dcq_BA | 108.30° | 73.42° | -64.76° | 82.94° | 120.98° | 16.23Å | 6.5 |
1nmc_HL | 110.09° | 71.80° | -64.06° | 80.19° | 120.88° | 16.16Å | 7.3 |
1ghf_HL | 110.63° | 71.68° | -61.52° | 81.98° | 122.12° | 16.05Å | 7.6 |
5te6_HL | 110.27° | 71.02° | -62.37° | 82.91° | 121.25° | 16.49Å | 7.7 |