Detailed entry information.
Click on any of the tabs below to see the detailed information about the structure.
Crystal Structure of a TCR in complex with HLA-A*11:01 Bound to Kras Peptide (Vvgavgvgk)
| Item | Info |
|---|---|
| PDB | 8i5d |
| Organism | MUS MUSCULUS |
| Method | X-RAY DIFFRACTION |
| Resolution | 3.3Å |
| Number of TCRs | 1 |
This PDB has 1 TCR(s).
| Item | Info |
|---|---|
| VB chain | B |
| VA chain | A |
| VB IMGT details | TRBV16/TRBJ2 |
| VA IMGT details | TRAV8/TRAJ22 |
| Species | mouse |
| Item | Info |
|---|---|
| Antigen Chain | P |
| Antigen Type | Peptide |
| Antigen Organism | HOMO SAPIENS |
| Antigen Sequence | VVGAVGVGK |
| Antigen Length | 9 |
| Item | Info |
|---|---|
| MHC Chain | H | L |
| MHC Type | MH1 |
| MHC Species | human |
| MHC IMGT details | HLA-A*1101 |
| Chain type | Chain ID | FASTA/Annotation file | IMGT numbered sequence (Framework/CDR) | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| VB | B | FASTA file |
|
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| VA | A | FASTA file |
|
| Loop | Sequence | Predicted canonical form | CDR Length |
|---|---|---|---|
| CDRB3 | ASSLEGTVEETLY | None | 13 |
| CDRB2 | FRNQAP | None | 6 |
| CDRB1 | SGHSA | None | 5 |
| CDRA3 | AASSGSWQLI | None | 10 |
| CDRA2 | IRSNERE | None | 7 |
| CDRA1 | TSITA | None | 5 |
| Angle | Value |
|---|---|
| BC2 | 105.56° |
| BC1 | 71.73° |
| BA | -65.25° |
| AC2 | 81.36° |
| AC1 | 126.32° |
| dc | 16.74Å |
| Docking angle | 45.34° |
| TCR PDB | BC2 | BC1 | BA | AC2 | AC1 | dc | TRangle Distance |
|---|---|---|---|---|---|---|---|
| 8vz8_DC | 105.58° | 71.75° | -65.27° | 80.76° | 124.60° | 16.54Å | 1.8 |
| 4z7w_HG | 105.17° | 72.54° | -64.75° | 79.67° | 126.96° | 16.95Å | 2.1 |
| 8vz9_DC | 106.18° | 72.14° | -63.32° | 81.74° | 125.40° | 16.62Å | 2.3 |
| 4z7w_FE | 104.51° | 72.44° | -65.42° | 79.27° | 127.25° | 16.80Å | 2.6 |
| 4elk_BA | 105.77° | 71.69° | -67.56° | 81.33° | 124.76° | 16.38Å | 2.8 |
| Antibody PDB | HC2 | HC1 | HL | LC2 | LC1 | dc | ABangle Distance |
|---|---|---|---|---|---|---|---|
| 3s96_AB | 107.61° | 73.57° | -66.51° | 82.70° | 120.78° | 16.43Å | 6.5 |
| 4dcq_BA | 108.30° | 73.42° | -64.76° | 82.94° | 120.98° | 16.23Å | 6.5 |
| 1nmc_HL | 110.09° | 71.80° | -64.06° | 80.19° | 120.88° | 16.16Å | 7.3 |
| 1ghf_HL | 110.63° | 71.68° | -61.52° | 81.98° | 122.12° | 16.05Å | 7.6 |
| 5te6_HL | 110.27° | 71.02° | -62.37° | 82.91° | 121.25° | 16.49Å | 7.7 |