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Valpha3S1 Vbeta13S1 Hla C 0602 Vrsrrclrl
Item | Info |
---|---|
PDB | 8shi |
Organism | HOMO SAPIENS |
Method | X-RAY DIFFRACTION |
Resolution | 2.90002Å |
Number of TCRs | 2 |
This PDB has 2 TCR(s).
Item | Info |
---|---|
VB chain | H |
VA chain | G |
VB IMGT details | TRBV6/TRBJ1 |
VA IMGT details | TRAV17/TRAJ45 |
Species | human |
Item | Info |
---|---|
Antigen Chain | C |
Antigen Type | Peptide |
Antigen Organism | HOMO SAPIENS |
Antigen Sequence | VRSRRALRL |
Antigen Length | 9 |
Item | Info |
---|---|
MHC Chain | A | B |
MHC Type | MH1 |
MHC Species | human |
MHC IMGT details | HLA-C*0604:HLA-C*0602 |
Chain type | Chain ID | FASTA/Annotation file | IMGT numbered sequence (Framework/CDR) | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
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VB | H | FASTA file |
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VA | G | FASTA file |
|
Loop | Sequence | Predicted canonical form | CDR Length |
---|---|---|---|
CDRB3 | ASSYSEGEDEAF | None | 12 |
CDRB2 | SVGAGI | None | 6 |
CDRB1 | MNHEY | None | 5 |
CDRA3 | ATDALYSGGGADGLT | None | 15 |
CDRA2 | IRSNERE | None | 7 |
CDRA1 | TSINN | None | 5 |
Angle | Value |
---|---|
BC2 | 104.52° |
BC1 | 70.56° |
BA | -65.77° |
AC2 | 76.59° |
AC1 | 121.21° |
dc | 16.17Å |
Docking angle | 20.97° |
TCR PDB | BC2 | BC1 | BA | AC2 | AC1 | dc | TRangle Distance |
---|---|---|---|---|---|---|---|
6cqq_JI | 103.99° | 72.99° | -66.58° | 76.49° | 121.31° | 15.89Å | 2.6 |
6cql_ED | 104.19° | 73.11° | -65.98° | 77.00° | 120.74° | 15.97Å | 2.7 |
6cqq_ED | 103.95° | 73.31° | -66.36° | 76.21° | 120.82° | 15.91Å | 2.9 |
6lir_BA | 105.00° | 70.85° | -66.57° | 74.88° | 123.55° | 16.31Å | 3.1 |
6cqn_ED | 103.61° | 72.65° | -67.65° | 75.37° | 120.90° | 16.00Å | 3.2 |
Antibody PDB | HC2 | HC1 | HL | LC2 | LC1 | dc | ABangle Distance |
---|---|---|---|---|---|---|---|
5jue_HL | 106.42° | 70.98° | -68.16° | 76.41° | 119.66° | 16.06Å | 3.5 |
4yfl_FI | 106.92° | 71.36° | -64.48° | 73.60° | 120.95° | 15.85Å | 4.1 |
4uil_HL | 109.73° | 69.62° | -65.41° | 77.88° | 119.52° | 16.24Å | 5.7 |
4uim_CD | 109.21° | 71.18° | -68.12° | 75.36° | 117.53° | 16.19Å | 6.6 |
12e8_HL | 106.48° | 69.23° | -70.96° | 74.63° | 118.60° | 16.05Å | 6.6 |
Item | Info |
---|---|
VB chain | J |
VA chain | I |
VB IMGT details | TRBV6/TRBJ1 |
VA IMGT details | TRAV17/TRAJ45 |
Species | human |
Item | Info |
---|---|
Antigen Chain | F |
Antigen Type | Peptide |
Antigen Organism | HOMO SAPIENS |
Antigen Sequence | VRSRRALRL |
Antigen Length | 9 |
Item | Info |
---|---|
MHC Chain | D | E |
MHC Type | MH1 |
MHC Species | human |
MHC IMGT details | HLA-C*0604:HLA-C*0602 |
Chain type | Chain ID | FASTA/Annotation file | IMGT numbered sequence (Framework/CDR) | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
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VB | J | FASTA file |
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VA | I | FASTA file |
|
Loop | Sequence | Predicted canonical form | CDR Length |
---|---|---|---|
CDRB3 | ASSYSEGEDEAF | None | 12 |
CDRB2 | SVGAGI | None | 6 |
CDRB1 | MNHEY | None | 5 |
CDRA3 | ATDALYSGGGADGLT | None | 15 |
CDRA2 | IRSNERE | None | 7 |
CDRA1 | TSINN | None | 5 |
Angle | Value |
---|---|
BC2 | 103.32° |
BC1 | 71.33° |
BA | -63.29° |
AC2 | 76.98° |
AC1 | 120.64° |
dc | 16.23Å |
Docking angle | 21.38° |
TCR PDB | BC2 | BC1 | BA | AC2 | AC1 | dc | TRangle Distance |
---|---|---|---|---|---|---|---|
3qeq_ED | 103.07° | 72.87° | -62.60° | 75.79° | 121.69° | 16.17Å | 2.3 |
1mwa_DC | 103.45° | 71.03° | -61.78° | 74.81° | 119.86° | 16.59Å | 2.8 |
3pl6_DC | 101.57° | 73.02° | -63.19° | 78.32° | 121.38° | 15.56Å | 3.0 |
4may_DC | 101.00° | 72.85° | -63.47° | 77.70° | 121.21° | 15.54Å | 3.0 |
6lir_DC | 103.55° | 71.82° | -63.77° | 78.79° | 122.98° | 16.32Å | 3.0 |
Antibody PDB | HC2 | HC1 | HL | LC2 | LC1 | dc | ABangle Distance |
---|---|---|---|---|---|---|---|
4yfl_FI | 106.92° | 71.36° | -64.48° | 73.60° | 120.95° | 15.85Å | 5.1 |
5jue_HL | 106.42° | 70.98° | -68.16° | 76.41° | 119.66° | 16.06Å | 5.9 |
4uil_HL | 109.73° | 69.62° | -65.41° | 77.88° | 119.52° | 16.24Å | 7.1 |
1nmc_HL | 110.09° | 71.80° | -64.06° | 80.19° | 120.88° | 16.16Å | 7.6 |
2vxu_IM | 110.96° | 71.68° | -62.78° | 78.60° | 119.89° | 16.17Å | 7.9 |