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Structure of anti-TCRvbeta6-5 antibody in complex with the Cognate TCR
Item | Info |
---|---|
PDB | 8tfn |
Organism | HOMO SAPIENS |
Method | X-RAY DIFFRACTION |
Resolution | 2.54Å |
Number of TCRs | 1 |
This PDB has 1 TCR(s).
Item | Info |
---|---|
VB chain | B |
VA chain | A |
VB IMGT details | TRBV6/TRBJ1 |
VA IMGT details | TRAV12/TRAJ27 |
Species | human |
Chain type | Chain ID | FASTA/Annotation file | IMGT numbered sequence (Framework/CDR) | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
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VB | B | FASTA file |
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VA | A | FASTA file |
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Loop | Sequence | Predicted canonical form | CDR Length |
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CDRB3 | ASSQGPFQPQH | None | 11 |
CDRB2 | SVGAGI | None | 6 |
CDRB1 | MNHEY | None | 5 |
CDRA3 | AMSGDLNTNAGKST | None | 14 |
CDRA2 | TYSSGN | A2-6-B | 6 |
CDRA1 | NSAFQY | None | 6 |
Angle | Value |
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BC2 | 100.45° |
BC1 | 70.20° |
BA | -55.86° |
AC2 | 83.24° |
AC1 | 125.21° |
dc | 16.87Å |
TCR PDB | BC2 | BC1 | BA | AC2 | AC1 | dc | TRangle Distance |
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8es7_BA | 99.21° | 70.44° | -55.67° | 84.06° | 126.10° | 17.05Å | 1.8 |
1qse_ED | 100.14° | 70.59° | -54.40° | 82.15° | 125.25° | 17.00Å | 1.9 |
3pwp_ED | 99.46° | 70.45° | -54.01° | 82.97° | 125.10° | 17.00Å | 2.1 |
3d3v_ED | 99.52° | 70.54° | -54.24° | 82.63° | 124.54° | 17.02Å | 2.1 |
3qfj_ED | 99.15° | 70.45° | -55.03° | 81.98° | 124.79° | 16.89Å | 2.1 |
Antibody PDB | HC2 | HC1 | HL | LC2 | LC1 | dc | ABangle Distance |
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3mnw_BA | 107.15° | 71.13° | -53.34° | 82.80° | 121.51° | 16.47Å | 8.1 |
4ydl_HL | 108.56° | 70.76° | -54.72° | 85.96° | 123.49° | 15.98Å | 8.9 |
3mnz_BA | 108.41° | 71.26° | -53.27° | 82.05° | 121.70° | 16.38Å | 9.2 |
1cfq_BA | 106.86° | 67.47° | -56.63° | 80.83° | 119.58° | 16.37Å | 9.3 |