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Human TCR a2.13 in complex with Dq8-inscpep
Item | Info |
---|---|
PDB | 8vcx |
Organism | HOMO SAPIENS |
Method | X-RAY DIFFRACTION |
Resolution | 2.59Å |
Number of TCRs | 1 |
This PDB has 1 TCR(s).
Item | Info |
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VB chain | E |
VA chain | D |
VB IMGT details | TRBV5/TRBJ2 |
VA IMGT details | TRAV26/TRAJ39 |
Species | human |
Item | Info |
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Antigen Chain | C |
Antigen Type | Peptide |
Antigen Organism | HOMO SAPIENS |
Antigen Sequence | GQVELGGGPGAESCQ |
Antigen Length | 15 |
Item | Info |
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MHC Chain | A | B |
MHC Type | MH2 |
MHC Species | human |
MHC IMGT details | HLA-DQA1*0301 / HLA-DQB1*0302 |
Chain type | Chain ID | FASTA/Annotation file | IMGT numbered sequence (Framework/CDR) | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
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VB | E | FASTA file |
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VA | D | FASTA file |
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Loop | Sequence | Predicted canonical form | CDR Length |
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CDRB3 | ASSLERETQY | None | 10 |
CDRB2 | YFSETQ | None | 6 |
CDRB1 | SGHRS | None | 5 |
CDRA3 | IVSHNAGNMLT | None | 11 |
CDRA2 | GLKNN | None | 5 |
CDRA1 | TISGNEY | None | 7 |
Angle | Value |
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BC2 | 100.98° |
BC1 | 73.35° |
BA | -59.37° |
AC2 | 96.72° |
AC1 | 127.74° |
dc | 17.16Å |
Docking angle | 32.41° |
TCR PDB | BC2 | BC1 | BA | AC2 | AC1 | dc | TRangle Distance |
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6xcp_ED | 101.92° | 73.95° | -59.10° | 96.21° | 127.51° | 17.14Å | 1.3 |
8vcy_ED | 101.96° | 73.32° | -60.11° | 94.98° | 127.70° | 17.20Å | 2.1 |
6u3o_BA | 99.94° | 72.47° | -55.86° | 97.29° | 128.96° | 17.74Å | 4.0 |
4ozg_HG | 102.14° | 72.61° | -57.16° | 93.52° | 129.20° | 17.54Å | 4.4 |
6u3o_HG | 99.07° | 72.44° | -55.96° | 97.99° | 128.67° | 17.75Å | 4.4 |