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the Crystal Structure of TCR Dmf5
Item | Info |
---|---|
PDB | 3qeu |
Organism | HOMO SAPIENS |
Method | X-RAY DIFFRACTION |
Resolution | 2.09Å |
Number of TCRs | 2 |
This PDB has 2 TCR(s).
Item | Info |
---|---|
VB chain | B |
VA chain | A |
VB IMGT details | TRBV6/TRBJ1 |
VA IMGT details | TRAV12/TRAJ23 |
Species | human |
Chain type | Chain ID | FASTA/Annotation file | IMGT numbered sequence (Framework/CDR) | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
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VB | B | FASTA file |
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VA | A | FASTA file |
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Loop | Sequence | Predicted canonical form | CDR Length |
---|---|---|---|
CDRB3 | ASSLSFGTEAF | None | 11 |
CDRB2 | SNTAGT | None | 6 |
CDRB1 | MRHNA | None | 5 |
CDRA3 | AVNFGGGKLI | A3-10-E | 10 |
CDRA2 | IYSNGD | None | 6 |
CDRA1 | DRGSQS | None | 6 |
Angle | Value |
---|---|
BC2 | 106.82° |
BC1 | 71.63° |
BA | -59.08° |
AC2 | 77.04° |
AC1 | 122.60° |
dc | 16.48Å |
TCR PDB | BC2 | BC1 | BA | AC2 | AC1 | dc | TRangle Distance |
---|---|---|---|---|---|---|---|
2ckb_DC | 107.12° | 72.74° | -58.19° | 78.24° | 122.91° | 16.16Å | 1.9 |
4nhu_DC | 106.20° | 72.62° | -57.60° | 76.51° | 123.48° | 16.53Å | 2.1 |
1mwa_BA | 104.83° | 72.25° | -59.58° | 77.40° | 122.34° | 16.58Å | 2.2 |
4g8e_BA | 106.67° | 72.72° | -60.52° | 77.51° | 123.85° | 16.52Å | 2.3 |
8i5c_YX | 106.49° | 73.15° | -60.25° | 78.11° | 124.04° | 16.56Å | 2.6 |
Antibody PDB | HC2 | HC1 | HL | LC2 | LC1 | dc | ABangle Distance |
---|---|---|---|---|---|---|---|
3mo1_BA | 109.77° | 73.00° | -58.46° | 81.03° | 119.12° | 16.26Å | 6.2 |
1nma_HL | 109.88° | 72.48° | -61.03° | 81.63° | 120.29° | 16.40Å | 6.3 |
2vxu_IM | 110.96° | 71.68° | -62.78° | 78.60° | 119.89° | 16.17Å | 6.4 |
2vxt_HL | 112.53° | 71.75° | -60.55° | 78.20° | 120.37° | 16.05Å | 6.4 |
5kte_HL | 112.24° | 69.79° | -60.09° | 77.74° | 119.92° | 16.52Å | 6.4 |
Item | Info |
---|---|
VB chain | E |
VA chain | D |
VB IMGT details | TRBV6/TRBJ1 |
VA IMGT details | TRAV12/TRAJ23 |
Species | human |
Chain type | Chain ID | FASTA/Annotation file | IMGT numbered sequence (Framework/CDR) | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
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VB | E | FASTA file |
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VA | D | FASTA file |
|
Loop | Sequence | Predicted canonical form | CDR Length |
---|---|---|---|
CDRB3 | ASSLSFGTEAF | None | 11 |
CDRB2 | SNTAGT | None | 6 |
CDRB1 | MRHNA | None | 5 |
CDRA3 | AVNFGGGKLI | A3-10-E | 10 |
CDRA2 | IYSNGD | None | 6 |
CDRA1 | DRGSQS | None | 6 |
Angle | Value |
---|---|
BC2 | 108.64° |
BC1 | 69.37° |
BA | -53.93° |
AC2 | 75.82° |
AC1 | 122.42° |
dc | 16.65Å |
TCR PDB | BC2 | BC1 | BA | AC2 | AC1 | dc | TRangle Distance |
---|---|---|---|---|---|---|---|
6uon_HG | 107.29° | 69.18° | -54.13° | 77.37° | 123.31° | 16.49Å | 2.3 |
6uon_JI | 107.43° | 70.48° | -52.56° | 77.50° | 121.87° | 16.26Å | 2.8 |
7q9b_ED | 106.42° | 70.13° | -55.86° | 77.50° | 122.50° | 16.18Å | 3.5 |
6am5_ED | 105.95° | 69.43° | -54.24° | 78.09° | 121.92° | 16.27Å | 3.6 |
3qdg_ED | 105.95° | 69.72° | -55.67° | 78.72° | 121.20° | 16.13Å | 4.5 |
Antibody PDB | HC2 | HC1 | HL | LC2 | LC1 | dc | ABangle Distance |
---|---|---|---|---|---|---|---|
1fj1_DC | 109.78° | 71.11° | -51.69° | 80.11° | 123.02° | 16.12Å | 5.3 |
4yfl_HL | 109.78° | 73.75° | -56.79° | 79.59° | 122.71° | 16.13Å | 6.6 |
3mnz_BA | 108.41° | 71.26° | -53.27° | 82.05° | 121.70° | 16.38Å | 6.6 |
1cfq_BA | 106.86° | 67.47° | -56.63° | 80.83° | 119.58° | 16.37Å | 6.9 |
1c5b_HL | 112.67° | 70.15° | -57.22° | 80.22° | 122.56° | 16.00Å | 6.9 |