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the Crystal Structure of TCR a6
Item | Info |
---|---|
PDB | 3qh3 |
Organism | HOMO SAPIENS |
Method | X-RAY DIFFRACTION |
Resolution | 2.19Å |
Number of TCRs | 2 |
This PDB has 2 TCR(s).
Item | Info |
---|---|
VB chain | B |
VA chain | A |
VB IMGT details | TRBV6/TRBJ2 |
VA IMGT details | TRAV12/TRAJ24 |
Species | human |
Chain type | Chain ID | FASTA/Annotation file | IMGT numbered sequence (Framework/CDR) | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
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VB | B | FASTA file |
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VA | A | FASTA file |
|
Loop | Sequence | Predicted canonical form | CDR Length |
---|---|---|---|
CDRB3 | ASRPGLAGGRPEQY | None | 14 |
CDRB2 | SVGAGI | None | 6 |
CDRB1 | MNHEY | None | 5 |
CDRA3 | AVTTDSWGKLQ | A3-11-C | 11 |
CDRA2 | IYSNGD | None | 6 |
CDRA1 | DRGSQS | None | 6 |
Angle | Value |
---|---|
BC2 | 105.57° |
BC1 | 74.49° |
BA | -59.76° |
AC2 | 76.29° |
AC1 | 122.79° |
dc | 16.23Å |
TCR PDB | BC2 | BC1 | BA | AC2 | AC1 | dc | TRangle Distance |
---|---|---|---|---|---|---|---|
4grm_DC | 105.08° | 75.19° | -60.89° | 76.33° | 122.81° | 16.09Å | 1.4 |
7rm4_NO | 105.38° | 74.83° | -61.30° | 76.97° | 121.77° | 15.91Å | 2.0 |
4grm_BA | 104.75° | 74.22° | -61.93° | 76.60° | 123.01° | 16.23Å | 2.4 |
8i5c_xw | 104.72° | 73.58° | -61.00° | 78.00° | 123.40° | 16.40Å | 2.5 |
7rm4_ST | 104.23° | 72.87° | -60.50° | 77.34° | 122.23° | 16.36Å | 2.5 |
Antibody PDB | HC2 | HC1 | HL | LC2 | LC1 | dc | ABangle Distance |
---|---|---|---|---|---|---|---|
4yfl_FI | 106.92° | 71.36° | -64.48° | 73.60° | 120.95° | 15.85Å | 6.7 |
3mo1_BA | 109.77° | 73.00° | -58.46° | 81.03° | 119.12° | 16.26Å | 7.6 |
1nma_HL | 109.88° | 72.48° | -61.03° | 81.63° | 120.29° | 16.40Å | 7.7 |
1n4x_HL | 110.31° | 76.00° | -65.51° | 77.43° | 122.43° | 15.84Å | 7.7 |
2vxu_IM | 110.96° | 71.68° | -62.78° | 78.60° | 119.89° | 16.17Å | 7.7 |
Item | Info |
---|---|
VB chain | D |
VA chain | C |
VB IMGT details | TRBV6/TRBJ2 |
VA IMGT details | TRAV12/TRAJ24 |
Species | human |
Chain type | Chain ID | FASTA/Annotation file | IMGT numbered sequence (Framework/CDR) | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
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VB | D | FASTA file |
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VA | C | FASTA file |
|
Loop | Sequence | Predicted canonical form | CDR Length |
---|---|---|---|
CDRB3 | ASRPGLAGGRPEQY | None | 14 |
CDRB2 | SVGAGI | None | 6 |
CDRB1 | MNHEY | None | 5 |
CDRA3 | AVTTDSWGKLQ | A3-11-C | 11 |
CDRA2 | IYSNGD | None | 6 |
CDRA1 | DRGSQS | None | 6 |
Angle | Value |
---|---|
BC2 | 103.38° |
BC1 | 73.21° |
BA | -61.36° |
AC2 | 77.35° |
AC1 | 122.64° |
dc | 16.34Å |
TCR PDB | BC2 | BC1 | BA | AC2 | AC1 | dc | TRangle Distance |
---|---|---|---|---|---|---|---|
7rm4_ST | 104.23° | 72.87° | -60.50° | 77.34° | 122.23° | 16.36Å | 1.3 |
4pjc_HG | 103.15° | 72.48° | -61.53° | 78.37° | 123.38° | 16.57Å | 1.5 |
7rm4_DE | 103.90° | 73.60° | -60.63° | 78.47° | 122.02° | 16.02Å | 1.6 |
6uz1_JI | 103.24° | 72.55° | -60.29° | 76.44° | 122.02° | 16.41Å | 1.7 |
8i5c_xw | 104.72° | 73.58° | -61.00° | 78.00° | 123.40° | 16.40Å | 1.8 |
Antibody PDB | HC2 | HC1 | HL | LC2 | LC1 | dc | ABangle Distance |
---|---|---|---|---|---|---|---|
4yfl_FI | 106.92° | 71.36° | -64.48° | 73.60° | 120.95° | 15.85Å | 6.5 |
1nmc_HL | 110.09° | 71.80° | -64.06° | 80.19° | 120.88° | 16.16Å | 8.1 |
1nma_HL | 109.88° | 72.48° | -61.03° | 81.63° | 120.29° | 16.40Å | 8.2 |
4uim_AB | 109.49° | 71.42° | -65.63° | 76.99° | 119.77° | 15.95Å | 8.2 |
4dcq_BA | 108.30° | 73.42° | -64.76° | 82.94° | 120.98° | 16.23Å | 8.4 |