Detailed entry information.
Click on any of the tabs below to see the detailed information about the structure.
Crystal Structure of Human alloreactive TCR Nb20
Item | Info |
---|---|
PDB | 3rev |
Organism | HOMO SAPIENS |
Method | X-RAY DIFFRACTION |
Resolution | 2.2Å |
Number of TCRs | 1 |
This PDB has 1 TCR(s).
Item | Info |
---|---|
VB chain | B |
VA chain | A |
VB IMGT details | TRBV6/TRBJ2 |
VA IMGT details | TRAV3/TRAJ29 |
Species | human |
Chain type | Chain ID | FASTA/Annotation file | IMGT numbered sequence (Framework/CDR) | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
VB | B | FASTA file |
|
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
VA | A | FASTA file |
|
Loop | Sequence | Predicted canonical form | CDR Length |
---|---|---|---|
CDRB3 | ASSYVSQNNEQF | None | 12 |
CDRB2 | SVGAGI | None | 6 |
CDRB1 | MNHEY | None | 5 |
CDRA3 | AVRDMNSGNTPLV | None | 13 |
CDRA2 | YITGDNLV | None | 8 |
CDRA1 | VSGNPY | None | 6 |
Angle | Value |
---|---|
BC2 | 101.29° |
BC1 | 71.79° |
BA | -60.65° |
AC2 | 78.74° |
AC1 | 124.05° |
dc | 16.31Å |
TCR PDB | BC2 | BC1 | BA | AC2 | AC1 | dc | TRangle Distance |
---|---|---|---|---|---|---|---|
4h1l_JI | 101.40° | 72.39° | -61.09° | 79.28° | 124.96° | 16.29Å | 1.3 |
8ye4_HG | 102.01° | 71.76° | -60.96° | 79.15° | 124.91° | 17.07Å | 1.4 |
8ye4_JI | 102.33° | 71.38° | -60.49° | 78.95° | 124.12° | 17.10Å | 1.4 |
4pjc_FE | 102.47° | 72.37° | -59.74° | 79.13° | 123.72° | 16.65Å | 1.7 |
3sjv_JI | 102.43° | 71.16° | -60.88° | 79.59° | 124.34° | 17.17Å | 1.8 |
Antibody PDB | HC2 | HC1 | HL | LC2 | LC1 | dc | ABangle Distance |
---|---|---|---|---|---|---|---|
4yfl_FI | 106.92° | 71.36° | -64.48° | 73.60° | 120.95° | 15.85Å | 9.1 |
1cfq_BA | 106.86° | 67.47° | -56.63° | 80.83° | 119.58° | 16.37Å | 9.5 |
4dcq_BA | 108.30° | 73.42° | -64.76° | 82.94° | 120.98° | 16.23Å | 9.8 |
1nma_HL | 109.88° | 72.48° | -61.03° | 81.63° | 120.29° | 16.40Å | 9.8 |