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1E6-a*0201-alwgpdpaaa complex, Monoclinic
Item | Info |
---|---|
PDB | 3uts |
Organism | HOMO SAPIENS |
Method | X-RAY DIFFRACTION |
Resolution | 2.712Å |
Number of TCRs | 2 |
This PDB has 2 TCR(s).
Item | Info |
---|---|
VB chain | E |
VA chain | D |
VB IMGT details | TRBV12/TRBJ2 |
VA IMGT details | TRAV12/TRAJ12 |
Species | human |
Item | Info |
---|---|
Antigen Chain | C |
Antigen Type | Peptide |
Antigen Organism | HOMO SAPIENS |
Antigen Sequence | ALWGPDPAAA |
Antigen Length | 10 |
Item | Info |
---|---|
MHC Chain | A | B |
MHC Type | MH1 |
MHC Species | human |
MHC IMGT details | HLA-A*0201 |
Chain type | Chain ID | FASTA/Annotation file | IMGT numbered sequence (Framework/CDR) | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
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VB | E | FASTA file |
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VA | D | FASTA file |
|
Loop | Sequence | Predicted canonical form | CDR Length |
---|---|---|---|
CDRB3 | ASSLWEKLAKNIQY | None | 14 |
CDRB2 | FNNNVP | None | 6 |
CDRB1 | SGHDY | None | 5 |
CDRA3 | AMRGDSSYKLI | None | 11 |
CDRA2 | TYSSGN | A2-6-B | 6 |
CDRA1 | NSAFQY | None | 6 |
Angle | Value |
---|---|
BC2 | 109.15° |
BC1 | 79.11° |
BA | -59.05° |
AC2 | 83.20° |
AC1 | 121.82° |
dc | 15.95Å |
Docking angle | 36.75° |
TCR PDB | BC2 | BC1 | BA | AC2 | AC1 | dc | TRangle Distance |
---|---|---|---|---|---|---|---|
6dfq_DC | 107.89° | 77.81° | -60.67° | 82.33° | 120.67° | 15.36Å | 2.9 |
2ol3_BA | 107.98° | 81.05° | -60.16° | 83.86° | 123.09° | 15.17Å | 3.0 |
5c08_JI | 111.51° | 79.52° | -60.13° | 81.85° | 122.01° | 15.86Å | 3.0 |
6dfq_HG | 106.37° | 78.88° | -59.70° | 82.62° | 121.42° | 15.08Å | 3.1 |
5c0a_ED | 110.76° | 79.27° | -60.64° | 81.16° | 122.52° | 15.82Å | 3.1 |
Antibody PDB | HC2 | HC1 | HL | LC2 | LC1 | dc | ABangle Distance |
---|---|---|---|---|---|---|---|
1dlf_HL | 110.03° | 78.05° | -59.13° | 79.41° | 118.65° | 15.73Å | 5.1 |
1cl7_HL | 111.63° | 74.67° | -60.00° | 82.67° | 121.69° | 16.39Å | 5.2 |
4jkp_HL | 113.93° | 77.37° | -58.92° | 82.11° | 124.47° | 15.16Å | 5.9 |
5jxa_HL | 113.80° | 75.84° | -58.79° | 84.76° | 121.40° | 15.72Å | 5.9 |
4jb9_HL | 113.44° | 75.69° | -60.19° | 83.50° | 119.19° | 15.84Å | 6.2 |
Item | Info |
---|---|
VB chain | J |
VA chain | I |
VB IMGT details | TRBV12/TRBJ2 |
VA IMGT details | TRAV12/TRAJ12 |
Species | human |
Item | Info |
---|---|
Antigen Chain | H |
Antigen Type | Peptide |
Antigen Organism | HOMO SAPIENS |
Antigen Sequence | ALWGPDPAAA |
Antigen Length | 10 |
Item | Info |
---|---|
MHC Chain | F | G |
MHC Type | MH1 |
MHC Species | human |
MHC IMGT details | HLA-A*0201 |
Chain type | Chain ID | FASTA/Annotation file | IMGT numbered sequence (Framework/CDR) | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
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VB | J | FASTA file |
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VA | I | FASTA file |
|
Loop | Sequence | Predicted canonical form | CDR Length |
---|---|---|---|
CDRB3 | ASSLWEKLAKNIQY | None | 14 |
CDRB2 | FNNNVP | None | 6 |
CDRB1 | SGHDY | None | 5 |
CDRA3 | AMRGDSSYKLI | None | 11 |
CDRA2 | TYSSGN | A2-6-B | 6 |
CDRA1 | NSAFQY | None | 6 |
Angle | Value |
---|---|
BC2 | 108.87° |
BC1 | 79.90° |
BA | -58.16° |
AC2 | 82.82° |
AC1 | 121.85° |
dc | 15.91Å |
Docking angle | 35.23° |
TCR PDB | BC2 | BC1 | BA | AC2 | AC1 | dc | TRangle Distance |
---|---|---|---|---|---|---|---|
2ol3_BA | 107.98° | 81.05° | -60.16° | 83.86° | 123.09° | 15.17Å | 3.0 |
6dfq_BA | 107.29° | 78.06° | -56.66° | 82.85° | 120.36° | 15.24Å | 3.3 |
6dfq_HG | 106.37° | 78.88° | -59.70° | 82.62° | 121.42° | 15.08Å | 3.3 |
5c08_JI | 111.51° | 79.52° | -60.13° | 81.85° | 122.01° | 15.86Å | 3.5 |
1nam_BA | 106.13° | 79.79° | -59.22° | 84.36° | 122.75° | 15.08Å | 3.5 |
Antibody PDB | HC2 | HC1 | HL | LC2 | LC1 | dc | ABangle Distance |
---|---|---|---|---|---|---|---|
1dlf_HL | 110.03° | 78.05° | -59.13° | 79.41° | 118.65° | 15.73Å | 5.3 |
1cl7_HL | 111.63° | 74.67° | -60.00° | 82.67° | 121.69° | 16.39Å | 6.2 |
4jkp_HL | 113.93° | 77.37° | -58.92° | 82.11° | 124.47° | 15.16Å | 6.4 |
5jxa_HL | 113.80° | 75.84° | -58.79° | 84.76° | 121.40° | 15.72Å | 6.7 |
2dlf_HL | 110.76° | 78.47° | -60.69° | 79.06° | 117.44° | 15.78Å | 6.8 |