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H27-14 TCR Specific For HLA-A24-Nef134-10
Item | Info |
---|---|
PDB | 3vxq |
Organism | HOMO SAPIENS |
Method | X-RAY DIFFRACTION |
Resolution | 2Å |
Number of TCRs | 2 |
This PDB has 2 TCR(s).
Item | Info |
---|---|
VB chain | B |
VA chain | A |
VB IMGT details | TRBV7/TRBJ2 |
VA IMGT details | TRAV21/TRAJ12 |
Species | human |
Chain type | Chain ID | FASTA/Annotation file | IMGT numbered sequence (Framework/CDR) | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
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VB | B | FASTA file |
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VA | A | FASTA file |
|
Loop | Sequence | Predicted canonical form | CDR Length |
---|---|---|---|
CDRB3 | ASSSWDTGELF | None | 11 |
CDRB2 | FQNEAQ | None | 6 |
CDRB1 | SEHNR | None | 5 |
CDRA3 | AVRMDSSYKLI | None | 11 |
CDRA2 | IQSSQRE | None | 7 |
CDRA1 | DSAIYN | None | 6 |
Angle | Value |
---|---|
BC2 | 102.71° |
BC1 | 73.42° |
BA | -58.65° |
AC2 | 80.10° |
AC1 | 120.88° |
dc | 15.91Å |
TCR PDB | BC2 | BC1 | BA | AC2 | AC1 | dc | TRangle Distance |
---|---|---|---|---|---|---|---|
7t2d_ED | 102.83° | 73.36° | -58.93° | 80.80° | 122.46° | 16.08Å | 1.8 |
4e41_ED | 102.89° | 73.20° | -60.14° | 80.58° | 122.38° | 15.80Å | 2.2 |
3vxr_ED | 101.24° | 72.51° | -56.96° | 80.94° | 120.91° | 15.73Å | 2.6 |
4udu_BA | 102.41° | 72.02° | -57.03° | 81.05° | 122.79° | 15.65Å | 3.0 |
7q99_ED | 103.40° | 75.70° | -58.23° | 80.04° | 122.68° | 15.69Å | 3.0 |
Antibody PDB | HC2 | HC1 | HL | LC2 | LC1 | dc | ABangle Distance |
---|---|---|---|---|---|---|---|
3mo1_BA | 109.77° | 73.00° | -58.46° | 81.03° | 119.12° | 16.26Å | 7.4 |
4hxb_HL | 109.66° | 72.24° | -59.19° | 82.14° | 119.35° | 16.41Å | 7.5 |
1cfq_BA | 106.86° | 67.47° | -56.63° | 80.83° | 119.58° | 16.37Å | 7.7 |
1nma_HL | 109.88° | 72.48° | -61.03° | 81.63° | 120.29° | 16.40Å | 7.8 |
3mnw_BA | 107.15° | 71.13° | -53.34° | 82.80° | 121.51° | 16.47Å | 7.8 |
Item | Info |
---|---|
VB chain | E |
VA chain | D |
VB IMGT details | TRBV7/TRBJ2 |
VA IMGT details | TRAV21/TRAJ12 |
Species | human |
Chain type | Chain ID | FASTA/Annotation file | IMGT numbered sequence (Framework/CDR) | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
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VB | E | FASTA file |
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VA | D | FASTA file |
|
Loop | Sequence | Predicted canonical form | CDR Length |
---|---|---|---|
CDRB3 | ASSSWDTGELF | None | 11 |
CDRB2 | FQNEAQ | None | 6 |
CDRB1 | SEHNR | None | 5 |
CDRA3 | AVRMDSSYKLI | None | 11 |
CDRA2 | IQSSQRE | None | 7 |
CDRA1 | DSAIYN | None | 6 |
Angle | Value |
---|---|
BC2 | 104.46° |
BC1 | 72.25° |
BA | -61.43° |
AC2 | 79.41° |
AC1 | 121.34° |
dc | 15.85Å |
TCR PDB | BC2 | BC1 | BA | AC2 | AC1 | dc | TRangle Distance |
---|---|---|---|---|---|---|---|
4e41_JI | 104.17° | 72.49° | -61.09° | 80.01° | 122.69° | 15.78Å | 1.6 |
7rm4_DE | 103.90° | 73.60° | -60.63° | 78.47° | 122.02° | 16.02Å | 2.0 |
1g6r_DC | 104.52° | 72.37° | -60.12° | 78.00° | 121.40° | 16.31Å | 2.0 |
5ks9_FE | 104.05° | 73.02° | -60.27° | 79.68° | 123.11° | 15.88Å | 2.3 |
5d7i_HG | 104.30° | 72.61° | -60.75° | 80.03° | 123.42° | 16.67Å | 2.4 |
Antibody PDB | HC2 | HC1 | HL | LC2 | LC1 | dc | ABangle Distance |
---|---|---|---|---|---|---|---|
1nma_HL | 109.88° | 72.48° | -61.03° | 81.63° | 120.29° | 16.40Å | 6.0 |
1nmc_HL | 110.09° | 71.80° | -64.06° | 80.19° | 120.88° | 16.16Å | 6.3 |
4dcq_BA | 108.30° | 73.42° | -64.76° | 82.94° | 120.98° | 16.23Å | 6.3 |
4hxb_HL | 109.66° | 72.24° | -59.19° | 82.14° | 119.35° | 16.41Å | 6.6 |
1dbk_HL | 110.44° | 73.17° | -62.13° | 81.71° | 119.85° | 16.60Å | 6.7 |