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Crystal Structure of a Human Valpha7.2/Vbeta13.2 Mait TCR in complex with Bovine Mr1
Item | Info |
---|---|
PDB | 4l9l |
Organism | HOMO SAPIENS |
Method | X-RAY DIFFRACTION |
Resolution | 3.4Å |
Number of TCRs | 1 |
This PDB has 1 TCR(s).
Item | Info |
---|---|
VB chain | B |
VA chain | A |
VB IMGT details | TRBV6/TRBJ1 |
VA IMGT details | TRAV1/TRAJ33 |
Species | human |
Item | Info |
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MHC Chain | C | NA |
MHC Type | MR1 |
MHC Species |
Chain type | Chain ID | FASTA/Annotation file | IMGT numbered sequence (Framework/CDR) | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
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VB | B | FASTA file |
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VA | A | FASTA file |
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Loop | Sequence | Predicted canonical form | CDR Length |
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CDRB3 | ASSYPPDGGNTIY | None | 13 |
CDRB2 | SVGEGT | None | 6 |
CDRB1 | MNHEY | None | 5 |
CDRA3 | APLDSNYQLI | None | 10 |
CDRA2 | NVLDGL | None | 6 |
CDRA1 | TSGFNG | A1-6-F | 6 |
Angle | Value |
---|---|
BC2 | 102.30° |
BC1 | 73.18° |
BA | -63.63° |
AC2 | 80.48° |
AC1 | 125.58° |
dc | 16.78Å |
Docking angle | 62.51° |
TCR PDB | BC2 | BC1 | BA | AC2 | AC1 | dc | TRangle Distance |
---|---|---|---|---|---|---|---|
6ovo_BA | 103.01° | 72.72° | -64.60° | 82.04° | 125.37° | 16.52Å | 2.0 |
3sjv_TS | 102.96° | 72.18° | -61.91° | 80.10° | 125.49° | 16.90Å | 2.1 |
6v80_IH | 101.62° | 72.99° | -64.05° | 79.81° | 127.48° | 17.14Å | 2.2 |
7zt4_ED | 103.15° | 72.15° | -63.39° | 79.15° | 124.46° | 16.62Å | 2.2 |
7zt5_ED | 103.23° | 72.34° | -63.43° | 79.07° | 124.43° | 16.59Å | 2.2 |
Antibody PDB | HC2 | HC1 | HL | LC2 | LC1 | dc | ABangle Distance |
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3s96_AB | 107.61° | 73.57° | -66.51° | 82.70° | 120.78° | 16.43Å | 8.0 |
4dcq_BA | 108.30° | 73.42° | -64.76° | 82.94° | 120.98° | 16.23Å | 8.1 |
1nmc_HL | 110.09° | 71.80° | -64.06° | 80.19° | 120.88° | 16.16Å | 9.2 |
1ghf_HL | 110.63° | 71.68° | -61.52° | 81.98° | 122.12° | 16.05Å | 9.5 |
1nma_HL | 109.88° | 72.48° | -61.03° | 81.63° | 120.29° | 16.40Å | 9.7 |