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Immune complex
Item | Info |
---|---|
PDB | 4y19 |
Organism | HOMO SAPIENS |
Method | X-RAY DIFFRACTION |
Resolution | 2.5Å |
Number of TCRs | 1 |
This PDB has 1 TCR(s).
Item | Info |
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VB chain | E |
VA chain | D |
VB IMGT details | TRBV6/TRBJ2 |
VA IMGT details | TRAV29/TRAJ52 |
Species | human |
Item | Info |
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Antigen Chain | C |
Antigen Type | Peptide |
Antigen Organism | HOMO SAPIENS |
Antigen Sequence | GSLQPLALEGSLQKRG |
Antigen Length | 16 |
Item | Info |
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MHC Chain | A | B |
MHC Type | MH2 |
MHC Species | human |
MHC IMGT details | HLA-DRA*0101 / HLA-DRB1*0401 |
Chain type | Chain ID | FASTA/Annotation file | IMGT numbered sequence (Framework/CDR) | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
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VB | E | FASTA file |
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VA | D | FASTA file |
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Loop | Sequence | Predicted canonical form | CDR Length |
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CDRB3 | ASRPRRDNEQF | None | 11 |
CDRB2 | SVGEGT | None | 6 |
CDRB1 | MNHEY | None | 5 |
CDRA3 | AASVYAGGTSYGKLT | None | 15 |
CDRA2 | ISSIKDK | None | 7 |
CDRA1 | NSMFDY | None | 6 |
Angle | Value |
---|---|
BC2 | 105.67° |
BC1 | 70.75° |
BA | -60.69° |
AC2 | 78.09° |
AC1 | 123.81° |
dc | 16.38Å |
Docking angle | 42.13° |
TCR PDB | BC2 | BC1 | BA | AC2 | AC1 | dc | TRangle Distance |
---|---|---|---|---|---|---|---|
4pj9_DC | 104.86° | 71.22° | -60.09° | 78.08° | 123.45° | 16.71Å | 1.2 |
4y1a_ED | 106.20° | 71.83° | -60.17° | 79.83° | 124.12° | 16.73Å | 2.2 |
8i5c_sr | 106.29° | 72.86° | -60.56° | 78.49° | 123.86° | 16.65Å | 2.3 |
4g8e_BA | 106.67° | 72.72° | -60.52° | 77.51° | 123.85° | 16.52Å | 2.3 |
4x6c_HG | 103.89° | 71.32° | -59.69° | 77.11° | 123.97° | 16.76Å | 2.4 |
Antibody PDB | HC2 | HC1 | HL | LC2 | LC1 | dc | ABangle Distance |
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1ghf_HL | 110.63° | 71.68° | -61.52° | 81.98° | 122.12° | 16.05Å | 6.7 |
4yfl_FI | 106.92° | 71.36° | -64.48° | 73.60° | 120.95° | 15.85Å | 6.7 |
1nmc_HL | 110.09° | 71.80° | -64.06° | 80.19° | 120.88° | 16.16Å | 6.7 |
1nma_HL | 109.88° | 72.48° | -61.03° | 81.63° | 120.29° | 16.40Å | 6.8 |
2vxu_IM | 110.96° | 71.68° | -62.78° | 78.60° | 119.89° | 16.17Å | 7.0 |