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Immune Receptor complex
Item | Info |
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PDB | 6xco |
Organism | HOMO SAPIENS |
Method | X-RAY DIFFRACTION |
Resolution | 2.9Å |
Number of TCRs | 1 |
This PDB has 1 TCR(s).
Item | Info |
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VB chain | E |
VA chain | D |
VB IMGT details | TRBV5/TRBJ1 |
VA IMGT details | TRAV20/TRAJ7 |
Species | human |
Item | Info |
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MHC Chain | A | B |
MHC Type | MH2 |
MHC Species | human |
MHC IMGT details | HLA-DQA1*0301 / HLA-DQB1*0302 |
Chain type | Chain ID | FASTA/Annotation file | IMGT numbered sequence (Framework/CDR) | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
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VB | E | FASTA file |
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VA | D | FASTA file |
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Loop | Sequence | Predicted canonical form | CDR Length |
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CDRB3 | ASSLERDGYT | None | 10 |
CDRB2 | YFSETQ | None | 6 |
CDRB1 | SGHRS | None | 5 |
CDRA3 | AVQAGGNNRLA | None | 11 |
CDRA2 | LYSAGEE | None | 7 |
CDRA1 | VSGLRG | None | 6 |
Angle | Value |
---|---|
BC2 | 106.09° |
BC1 | 72.66° |
BA | -60.59° |
AC2 | 81.18° |
AC1 | 123.57° |
dc | 16.24Å |
Docking angle | 34.91° |
TCR PDB | BC2 | BC1 | BA | AC2 | AC1 | dc | TRangle Distance |
---|---|---|---|---|---|---|---|
5d5m_HG | 104.87° | 72.45° | -60.33° | 80.50° | 124.02° | 16.77Å | 1.6 |
5d7j_HG | 104.60° | 72.67° | -60.32° | 80.40° | 123.64° | 16.71Å | 1.8 |
4y1a_ED | 106.20° | 71.83° | -60.17° | 79.83° | 124.12° | 16.73Å | 1.8 |
4pjg_HG | 104.58° | 73.37° | -61.10° | 81.28° | 123.99° | 16.74Å | 1.9 |
4pj7_HG | 105.25° | 72.70° | -59.22° | 80.59° | 124.15° | 16.85Å | 1.9 |
Antibody PDB | HC2 | HC1 | HL | LC2 | LC1 | dc | ABangle Distance |
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1ghf_HL | 110.63° | 71.68° | -61.52° | 81.98° | 122.12° | 16.05Å | 5.0 |
1nma_HL | 109.88° | 72.48° | -61.03° | 81.63° | 120.29° | 16.40Å | 5.1 |
5te7_HL | 110.03° | 71.72° | -60.97° | 83.32° | 120.63° | 16.37Å | 5.5 |
5te6_HL | 110.27° | 71.02° | -62.37° | 82.91° | 121.25° | 16.49Å | 5.6 |
4dcq_BA | 108.30° | 73.42° | -64.76° | 82.94° | 120.98° | 16.23Å | 5.7 |