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as4.3-Yeih-Hla*B27
Item | Info |
---|---|
PDB | 7n2q |
Organism | HOMO SAPIENS |
Method | X-RAY DIFFRACTION |
Resolution | 2.7Å |
Number of TCRs | 2 |
This PDB has 2 TCR(s).
Item | Info |
---|---|
VB chain | F |
VA chain | D |
VB IMGT details | TRBV9/TRBJ2 |
VA IMGT details | TRAV21/TRAJ21 |
Species | human |
Item | Info |
---|---|
Antigen Chain | C |
Antigen Type | Peptide |
Antigen Organism | ESCHERICHIA COLI |
Antigen Sequence | LRVMMLAPF |
Antigen Length | 9 |
Item | Info |
---|---|
MHC Chain | A | B |
MHC Type | MH1 |
MHC Species | human |
MHC IMGT details | HLA-B*2705 |
Chain type | Chain ID | FASTA/Annotation file | IMGT numbered sequence (Framework/CDR) | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
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VB | F | FASTA file |
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VA | D | FASTA file |
|
Loop | Sequence | Predicted canonical form | CDR Length |
---|---|---|---|
CDRB3 | ASSVATYSTDTQY | None | 13 |
CDRB2 | YYNGEE | None | 6 |
CDRB1 | SGDLS | None | 5 |
CDRA3 | AVSNFNKFY | None | 9 |
CDRA2 | IQSSQRE | None | 7 |
CDRA1 | DSAIYN | None | 6 |
Angle | Value |
---|---|
BC2 | 106.86° |
BC1 | 75.26° |
BA | -63.31° |
AC2 | 78.46° |
AC1 | 119.87° |
dc | 15.74Å |
Docking angle | 22.17° |
TCR PDB | BC2 | BC1 | BA | AC2 | AC1 | dc | TRangle Distance |
---|---|---|---|---|---|---|---|
7n2n_FD | 105.58° | 75.18° | -63.42° | 77.58° | 119.77° | 15.95Å | 1.6 |
7n2s_FD | 105.79° | 75.67° | -63.01° | 76.83° | 119.55° | 15.81Å | 2.0 |
7n2o_FD | 106.34° | 74.73° | -64.81° | 77.13° | 120.85° | 15.94Å | 2.4 |
5nmf_JI | 105.95° | 76.00° | -61.13° | 79.92° | 120.15° | 15.36Å | 2.9 |
4elk_DC | 107.78° | 73.08° | -62.74° | 78.08° | 121.76° | 16.21Å | 3.1 |
Antibody PDB | HC2 | HC1 | HL | LC2 | LC1 | dc | ABangle Distance |
---|---|---|---|---|---|---|---|
5f9w_HL | 110.50° | 73.01° | -61.98° | 80.06° | 118.29° | 16.39Å | 5.1 |
1nmc_HL | 110.09° | 71.80° | -64.06° | 80.19° | 120.88° | 16.16Å | 5.2 |
4dcq_BA | 108.30° | 73.42° | -64.76° | 82.94° | 120.98° | 16.23Å | 5.4 |
1dbk_HL | 110.44° | 73.17° | -62.13° | 81.71° | 119.85° | 16.60Å | 5.5 |
2vxu_IM | 110.96° | 71.68° | -62.78° | 78.60° | 119.89° | 16.17Å | 5.5 |
Item | Info |
---|---|
VB chain | G |
VA chain | E |
VB IMGT details | TRBV9/TRBJ2 |
VA IMGT details | TRAV21/TRAJ21 |
Species | human |
Item | Info |
---|---|
Antigen Chain | J |
Antigen Type | Peptide |
Antigen Organism | ESCHERICHIA COLI |
Antigen Sequence | LRVMMLAPF |
Antigen Length | 9 |
Item | Info |
---|---|
MHC Chain | H | I |
MHC Type | MH1 |
MHC Species | human |
MHC IMGT details | HLA-B*2705 |
Chain type | Chain ID | FASTA/Annotation file | IMGT numbered sequence (Framework/CDR) | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
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VB | G | FASTA file |
|
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VA | E | FASTA file |
|
Loop | Sequence | Predicted canonical form | CDR Length |
---|---|---|---|
CDRB3 | ASSVATYSTDTQY | None | 13 |
CDRB2 | YYNGEE | None | 6 |
CDRB1 | SGDLS | None | 5 |
CDRA3 | AVSNFNKFY | None | 9 |
CDRA2 | IQSSQRE | None | 7 |
CDRA1 | DSAIYN | None | 6 |
Angle | Value |
---|---|
BC2 | 106.59° |
BC1 | 76.10° |
BA | -61.16° |
AC2 | 78.55° |
AC1 | 120.08° |
dc | 15.80Å |
Docking angle | 21.04° |
TCR PDB | BC2 | BC1 | BA | AC2 | AC1 | dc | TRangle Distance |
---|---|---|---|---|---|---|---|
5nmf_JI | 105.95° | 76.00° | -61.13° | 79.92° | 120.15° | 15.36Å | 1.6 |
5nme_ED | 106.95° | 76.37° | -60.59° | 80.74° | 120.38° | 15.51Å | 2.3 |
7n2s_FD | 105.79° | 75.67° | -63.01° | 76.83° | 119.55° | 15.81Å | 2.7 |
7n2n_FD | 105.58° | 75.18° | -63.42° | 77.58° | 119.77° | 15.95Å | 2.8 |
7rm4_NO | 105.38° | 74.83° | -61.30° | 76.97° | 121.77° | 15.91Å | 2.9 |
Antibody PDB | HC2 | HC1 | HL | LC2 | LC1 | dc | ABangle Distance |
---|---|---|---|---|---|---|---|
1dlf_HL | 110.03° | 78.05° | -59.13° | 79.41° | 118.65° | 15.73Å | 4.7 |
2dlf_HL | 110.76° | 78.47° | -60.69° | 79.06° | 117.44° | 15.78Å | 5.5 |
5f9w_HL | 110.50° | 73.01° | -61.98° | 80.06° | 118.29° | 16.39Å | 5.6 |
1nma_HL | 109.88° | 72.48° | -61.03° | 81.63° | 120.29° | 16.40Å | 5.8 |
3mo1_BA | 109.77° | 73.00° | -58.46° | 81.03° | 119.12° | 16.26Å | 5.9 |