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Structure of E8 TCR in complex in Human Mr1 K43a
Item | Info |
---|---|
PDB | 7zt3 |
Organism | HOMO SAPIENS |
Method | X-RAY DIFFRACTION |
Resolution | 2.4Å |
Number of TCRs | 1 |
This PDB has 1 TCR(s).
Item | Info |
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VB chain | E |
VA chain | D |
VB IMGT details | TRBV6/TRBJ1 |
VA IMGT details | TRAV1/TRAJ33 |
Species | human |
Item | Info |
---|---|
MHC Chain | A | B |
MHC Type | MR1 |
MHC Species | human |
MHC IMGT details | MR1*01 |
Chain type | Chain ID | FASTA/Annotation file | IMGT numbered sequence (Framework/CDR) | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
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VB | E | FASTA file |
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VA | D | FASTA file |
|
Loop | Sequence | Predicted canonical form | CDR Length |
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CDRB3 | ASSNREYSPLH | None | 11 |
CDRB2 | SASEGT | None | 6 |
CDRB1 | MNHNY | None | 5 |
CDRA3 | AFLDSNYQLI | None | 10 |
CDRA2 | NVLDGL | None | 6 |
CDRA1 | TSGFNG | A1-6-F | 6 |
Angle | Value |
---|---|
BC2 | 102.64° |
BC1 | 70.92° |
BA | -61.06° |
AC2 | 82.28° |
AC1 | 125.61° |
dc | 16.96Å |
Docking angle | 58.83° |
TCR PDB | BC2 | BC1 | BA | AC2 | AC1 | dc | TRangle Distance |
---|---|---|---|---|---|---|---|
7zt8_ED | 102.98° | 70.77° | -62.30° | 81.33° | 125.87° | 16.92Å | 1.6 |
3e3q_JI | 103.36° | 71.56° | -60.33° | 81.03° | 124.91° | 16.84Å | 1.9 |
3e3q_FC | 103.27° | 71.80° | -59.98° | 81.04° | 125.23° | 16.79Å | 2.0 |
3e3q_NM | 103.85° | 71.84° | -59.79° | 81.45° | 125.08° | 16.85Å | 2.2 |
3e3q_ED | 103.32° | 72.06° | -59.90° | 80.87° | 125.10° | 16.80Å | 2.3 |
Antibody PDB | HC2 | HC1 | HL | LC2 | LC1 | dc | ABangle Distance |
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4dcq_BA | 108.30° | 73.42° | -64.76° | 82.94° | 120.98° | 16.23Å | 8.6 |
1ghf_HL | 110.63° | 71.68° | -61.52° | 81.98° | 122.12° | 16.05Å | 8.8 |
5te6_HL | 110.27° | 71.02° | -62.37° | 82.91° | 121.25° | 16.49Å | 8.9 |
5te7_HL | 110.03° | 71.72° | -60.97° | 83.32° | 120.63° | 16.37Å | 9.0 |
1nma_HL | 109.88° | 72.48° | -61.03° | 81.63° | 120.29° | 16.40Å | 9.2 |