SAbDab: The Structural Antibody Database

> Structural Summary

Therapeutic	Anvatabart
Target	ERBB2
Heavy Chain	EVQLVESGGGLVQPGGSLRLSCAASGFNIKDTYIHWVRQAPGKGLEWVARIYPTNGYTRYADSVKGRFTISADTSKNTAYLQMNSLRAEDTAVYYCSRWGGDGFYAMDYWGQGTLVTVSS
Light Chain	DIQMTQSPSSLSASVGDRVTITCRASQDVNTAVAWYQQKPGKAPKLLIYSASFLYSGVPSRFSGSRSGTDFTLTISSLQPEDFATYYCQQHYTTPPTFGQGTKVEIK
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95-98% seqID Fv Structure	1fvd [Fvs: BA, DC], 3bdy [Fvs: HL], 3be1 [Fvs: HL], 4hjg [Fvs: BA], 4ioi [Fvs: BA], 4x4y [Fvs: AB, CD], 5tdn [Fvs: BA, DC], 5tdo [Fvs: DC], 5tdp [Fvs: BA, DC], 5u3d [Fvs: BA], 5u5f [Fvs: BA], 5u5m [Fvs: BA], 5u6a [Fvs: BA], 6b9y [Fvs: BA], 6b9z [Fvs: BA], 6bae [Fvs: BA], 6bah [Fvs: BA], 6dn0 [Fvs: AB, CD], 6mxr [Fvs: AB, HL], 6mxs [Fvs: AB, HL], 6my4 [Fvs: AB, HL], 6my5 [Fvs: AB, HL]

> SAbDab Links

100% seqID Structure	1fvc [Fvs: BA, DC]
100% seqID Structure	4hkz [Fvs: BA]
100% seqID Structure	1n8z [Fvs: BA]
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95-98% seqID Structure	6my5 [Fvs: AB, HL]
95-98% seqID Structure	6mxr [Fvs: AB, HL]

> Alignments

Non-identical sequences have been numbered using the Chothia scheme and aligned to Anvatabart.
CDR positions are indicated in blue. Mismatching positions are highlighted in orange.

> 1fve: B/A

Sequence identity: 99.56%

Heavy chain

Position	1	2	3	4	5	6	7	8	9	10	11	12	13	14	15	16	17	18	19	20	21	22	23	24	25	26	27	28	29	30	31	32	33	34	35	36	37	38	39	40	41	42	43	44	45	46	47	48	49	50	51	52	52A	53	54	55	56	57	58	59	60	61	62	63	64	65	66	67	68	69	70	71	72	73	74	75	76	77	78	79	80	81	82	82A	82B	82C	83	84	85	86	87	88	89	90	91	92	93	94	95	96	97	98	99	100	100A	100B	100C	101	102	103	104	105	106	107	108	109	110	111	112	113
anvatabart	E	V	Q	L	V	E	S	G	G	G	L	V	Q	P	G	G	S	L	R	L	S	C	A	A	S	G	F	N	I	K	D	T	Y	I	H	W	V	R	Q	A	P	G	K	G	L	E	W	V	A	R	I	Y	P	T	N	G	Y	T	R	Y	A	D	S	V	K	G	R	F	T	I	S	A	D	T	S	K	N	T	A	Y	L	Q	M	N	S	L	R	A	E	D	T	A	V	Y	Y	C	S	R	W	G	G	D	G	F	Y	A	M	D	Y	W	G	Q	G	T	L	V	T	V	S	S
1fve	E	V	Q	L	V	E	S	G	G	G	L	V	Q	P	G	G	S	L	R	L	S	C	A	A	S	G	F	N	I	K	D	T	Y	I	H	W	V	R	Q	A	P	G	K	G	L	E	W	V	A	R	I	Y	P	T	N	G	Y	T	R	Y	A	D	S	V	K	G	R	F	T	I	S	A	D	T	S	K	N	T	A	Y	L	Q	M	N	S	L	R	A	E	D	T	A	V	Y	Y	C	S	R	W	G	G	D	G	F	Y	A	M	D	Y	W	G	Q	G	T	L	V	T	V	S	S

Light chain

Position	1	2	3	4	5	6	7	8	9	10	11	12	13	14	15	16	17	18	19	20	21	22	23	24	25	26	27	28	29	30	31	32	33	34	35	36	37	38	39	40	41	42	43	44	45	46	47	48	49	50	51	52	53	54	55	56	57	58	59	60	61	62	63	64	65	66	67	68	69	70	71	72	73	74	75	76	77	78	79	80	81	82	83	84	85	86	87	88	89	90	91	92	93	94	95	96	97	98	99	100	101	102	103	104	105	106	107
anvatabart	D	I	Q	M	T	Q	S	P	S	S	L	S	A	S	V	G	D	R	V	T	I	T	C	R	A	S	Q	D	V	N	T	A	V	A	W	Y	Q	Q	K	P	G	K	A	P	K	L	L	I	Y	S	A	S	F	L	Y	S	G	V	P	S	R	F	S	G	S	R	S	G	T	D	F	T	L	T	I	S	S	L	Q	P	E	D	F	A	T	Y	Y	C	Q	Q	H	Y	T	T	P	P	T	F	G	Q	G	T	K	V	E	I	K
1fve	D	I	Q	M	T	Q	S	P	S	S	L	S	A	S	V	G	D	R	V	T	I	T	C	R	A	S	Q	D	V	N	T	A	V	A	W	Y	Q	Q	K	P	G	K	A	P	K	L	L	I	Y	S	A	S	F	L	E	S	G	V	P	S	R	F	S	G	S	R	S	G	T	D	F	T	L	T	I	S	S	L	Q	P	E	D	F	A	T	Y	Y	C	Q	Q	H	Y	T	T	P	P	T	F	G	Q	G	T	K	V	E	I	K

> 7t98: A/B

Sequence identity: 99.56%

Heavy chain

Position	1	2	3	4	5	6	7	8	9	10	11	12	13	14	15	16	17	18	19	20	21	22	23	24	25	26	27	28	29	30	31	32	33	34	35	36	37	38	39	40	41	42	43	44	45	46	47	48	49	50	51	52	52A	53	54	55	56	57	58	59	60	61	62	63	64	65	66	67	68	69	70	71	72	73	74	75	76	77	78	79	80	81	82	82A	82B	82C	83	84	85	86	87	88	89	90	91	92	93	94	95	96	97	98	99	100	100A	100B	100C	101	102	103	104	105	106	107	108	109	110	111	112	113
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7t98	E	V	Q	L	V	E	S	G	G	G	L	V	Q	P	G	G	S	L	R	L	S	C	A	A	S	G	F	N	I	K	D	T	Y	I	H	W	V	R	Q	A	P	G	K	G	L	E	W	V	A	R	I	Y	P	T	N	G	Y	T	R	Y	A	D	S	V	K	G	R	F	T	I	S	A	D	T	S	K	N	T	A	Y	L	Q	M	N	S	L	R	A	E	D	T	A	V	Y	Y	C	S	R	W	G	G	D	G	F	Y	A	M	D	Y	W	G	Q	G	T	L	V	T	V	S	S

Light chain

Position	1	2	3	4	5	6	7	8	9	10	11	12	13	14	15	16	17	18	19	20	21	22	23	24	25	26	27	28	29	30	31	32	33	34	35	36	37	38	39	40	41	42	43	44	45	46	47	48	49	50	51	52	53	54	55	56	57	58	59	60	61	62	63	64	65	66	67	68	69	70	71	72	73	74	75	76	77	78	79	80	81	82	83	84	85	86	87	88	89	90	91	92	93	94	95	96	97	98	99	100	101	102	103	104	105	106	107
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> 4x4x: A/B

Sequence identity: 99.12%

Heavy chain

Position	1	2	3	4	5	6	7	8	9	10	11	12	13	14	15	16	17	18	19	20	21	22	23	24	25	26	27	28	29	30	31	32	33	34	35	36	37	38	39	40	41	42	43	44	45	46	47	48	49	50	51	52	52A	53	54	55	56	57	58	59	60	61	62	63	64	65	66	67	68	69	70	71	72	73	74	75	76	77	78	79	80	81	82	82A	82B	82C	83	84	85	86	87	88	89	90	91	92	93	94	95	96	97	98	99	100	100A	100B	100C	101	102	103	104	105	106	107	108	109	110	111	112	113
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Light chain

Position	1	2	3	4	5	6	7	8	9	10	11	12	13	14	15	16	17	18	19	20	21	22	23	24	25	26	27	28	29	30	31	32	33	34	35	36	37	38	39	40	41	42	43	44	45	46	47	48	49	50	51	52	53	54	55	56	57	58	59	60	61	62	63	64	65	66	67	68	69	70	71	72	73	74	75	76	77	78	79	80	81	82	83	84	85	86	87	88	89	90	91	92	93	94	95	96	97	98	99	100	101	102	103	104	105	106	107
anvatabart	D	I	Q	M	T	Q	S	P	S	S	L	S	A	S	V	G	D	R	V	T	I	T	C	R	A	S	Q	D	V	N	T	A	V	A	W	Y	Q	Q	K	P	G	K	A	P	K	L	L	I	Y	S	A	S	F	L	Y	S	G	V	P	S	R	F	S	G	S	R	S	G	T	D	F	T	L	T	I	S	S	L	Q	P	E	D	F	A	T	Y	Y	C	Q	Q	H	Y	T	T	P	P	T	F	G	Q	G	T	K	V	E	I	K
4x4x	D	I	Q	M	T	Q	S	P	S	S	L	S	A	S	V	G	D	R	V	T	I	T	C	R	A	S	Q	D	V	N	T	A	V	A	W	Y	Q	Q	K	P	G	K	A	P	K	L	L	I	Y	S	A	D	F	L	Y	S	G	V	P	S	R	F	S	G	S	R	S	G	T	D	F	T	L	T	I	S	S	L	Q	P	E	D	F	A	T	Y	Y	C	Q	Q	H	Y	T	T	P	P	T	F	G	Q	G	T	K	V	E	I	K

> 6bgt: B/A

Sequence identity: 99.12%

Heavy chain

Position	1	2	3	4	5	6	7	8	9	10	11	12	13	14	15	16	17	18	19	20	21	22	23	24	25	26	27	28	29	30	31	32	33	34	35	36	37	38	39	40	41	42	43	44	45	46	47	48	49	50	51	52	52A	53	54	55	56	57	58	59	60	61	62	63	64	65	66	67	68	69	70	71	72	73	74	75	76	77	78	79	80	81	82	82A	82B	82C	83	84	85	86	87	88	89	90	91	92	93	94	95	96	97	98	99	100	100A	100B	100C	101	102	103	104	105	106	107	108	109	110	111	112	113
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6bgt	E	V	Q	L	V	E	S	G	G	G	L	V	Q	P	G	G	S	L	R	L	S	C	A	A	S	G	F	N	I	D	D	T	Y	I	H	W	V	R	Q	A	P	G	K	G	L	E	W	V	A	R	I	Y	P	T	N	G	Y	T	R	Y	A	D	S	V	K	G	R	F	T	I	S	A	D	T	S	K	N	T	A	Y	L	Q	M	N	S	L	R	A	E	D	T	A	V	Y	Y	C	S	R	W	G	G	D	G	F	Y	A	M	D	Y	W	G	Q	G	T	L	V	T	V	S	S

Light chain

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> 7kbp: C/C

Sequence identity: 99.12%

Heavy chain

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Light chain

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> 5tdo: D/C

Sequence identity: 98.68%

Heavy chain

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Light chain

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> 5tdn: B/A

Sequence identity: 98.68%

Heavy chain

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Light chain

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> 5tdp: B/A

Sequence identity: 98.68%

Heavy chain

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Light chain

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> 4x4y: A/B

Sequence identity: 98.68%

Heavy chain

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Light chain

Position	1	2	3	4	5	6	7	8	9	10	11	12	13	14	15	16	17	18	19	20	21	22	23	24	25	26	27	28	29	30	31	32	33	34	35	36	37	38	39	40	41	42	43	44	45	46	47	48	49	50	51	52	53	54	55	56	57	58	59	60	61	62	63	64	65	66	67	68	69	70	71	72	73	74	75	76	77	78	79	80	81	82	83	84	85	86	87	88	89	90	91	92	93	94	95	96	97	98	99	100	101	102	103	104	105	106	107
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4x4y	D	I	Q	M	T	Q	S	P	S	S	L	S	A	S	V	G	D	R	V	T	I	T	C	R	A	S	Q	D	V	N	T	A	V	A	W	Y	Q	Q	K	P	G	K	A	P	K	L	L	I	Y	S	A	D	F	L	Y	S	G	V	P	S	R	F	S	G	S	R	S	G	T	D	F	T	L	T	I	S	S	L	Q	P	E	D	F	A	T	Y	Y	C	Q	Q	H	Y	T	T	P	P	T	F	G	Q	G	T	K	V	E	I	K

> 1fvd: B/A

Sequence identity: 98.68%

Heavy chain

Position	1	2	3	4	5	6	7	8	9	10	11	12	13	14	15	16	17	18	19	20	21	22	23	24	25	26	27	28	29	30	31	32	33	34	35	36	37	38	39	40	41	42	43	44	45	46	47	48	49	50	51	52	52A	53	54	55	56	57	58	59	60	61	62	63	64	65	66	67	68	69	70	71	72	73	74	75	76	77	78	79	80	81	82	82A	82B	82C	83	84	85	86	87	88	89	90	91	92	93	94	95	96	97	98	99	100	100A	100B	100C	101	102	103	104	105	106	107	108	109	110	111	112	113
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Light chain

Position	1	2	3	4	5	6	7	8	9	10	11	12	13	14	15	16	17	18	19	20	21	22	23	24	25	26	27	28	29	30	31	32	33	34	35	36	37	38	39	40	41	42	43	44	45	46	47	48	49	50	51	52	53	54	55	56	57	58	59	60	61	62	63	64	65	66	67	68	69	70	71	72	73	74	75	76	77	78	79	80	81	82	83	84	85	86	87	88	89	90	91	92	93	94	95	96	97	98	99	100	101	102	103	104	105	106	107
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> 6dn0: A/B

Sequence identity: 98.23%

Heavy chain

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Light chain

Position	1	2	3	4	5	6	7	8	9	10	11	12	13	14	15	16	17	18	19	20	21	22	23	24	25	26	27	28	29	30	31	32	33	34	35	36	37	38	39	40	41	42	43	44	45	46	47	48	49	50	51	52	53	54	55	56	57	58	59	60	61	62	63	64	65	66	67	68	69	70	71	72	73	74	75	76	77	78	79	80	81	82	83	84	85	86	87	88	89	90	91	92	93	94	95	96	97	98	99	100	101	102	103	104	105	106	107
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> 3be1: H/L

Sequence identity: 94.71%

Heavy chain

Position	1	2	3	4	5	6	7	8	9	10	11	12	13	14	15	16	17	18	19	20	21	22	23	24	25	26	27	28	29	30	31	32	33	34	35	36	37	38	39	40	41	42	43	44	45	46	47	48	49	50	51	52	52A	53	54	55	56	57	58	59	60	61	62	63	64	65	66	67	68	69	70	71	72	73	74	75	76	77	78	79	80	81	82	82A	82B	82C	83	84	85	86	87	88	89	90	91	92	93	94	95	96	97	98	99	100	100A	100B	100C	101	102	103	104	105	106	107	108	109	110	111	112	113
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Light chain

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> 3bdy: H/L

Sequence identity: 94.71%

Heavy chain

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Light chain

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> 5u6a: B/A

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Light chain

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> 5u3d: B/A

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Light chain

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> 6b9z: B/A

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> 5u5m: B/A

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Light chain

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> 6bah: B/A

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Heavy chain

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Light chain

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> 4ioi: B/A

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Heavy chain

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Light chain

Position	1	2	3	4	5	6	7	8	9	10	11	12	13	14	15	16	17	18	19	20	21	22	23	24	25	26	27	28	29	30	31	32	33	34	35	36	37	38	39	40	41	42	43	44	45	46	47	48	49	50	51	52	53	54	55	56	57	58	59	60	61	62	63	64	65	66	67	68	69	70	71	72	73	74	75	76	77	78	79	80	81	82	83	84	85	86	87	88	89	90	91	92	93	94	95	96	97	98	99	100	101	102	103	104	105	106	107
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> 4hjg: B/A

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Heavy chain

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Light chain

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> 6bae: B/A

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Heavy chain

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Light chain

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> 6b9y: B/A

Sequence identity: 94.27%

Heavy chain

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Light chain

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> 6my4: A/B

Sequence identity: 93.39%

Heavy chain

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Light chain

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> 6mxs: A/B

Sequence identity: 93.39%

Heavy chain

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Light chain

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> 6my5: A/B

Sequence identity: 93.39%

Heavy chain

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Light chain

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> 6mxr: A/B

Sequence identity: 93.39%

Heavy chain

Position	1	2	3	4	5	6	7	8	9	10	11	12	13	14	15	16	17	18	19	20	21	22	23	24	25	26	27	28	29	30	31	32	33	34	35	36	37	38	39	40	41	42	43	44	45	46	47	48	49	50	51	52	52A	53	54	55	56	57	58	59	60	61	62	63	64	65	66	67	68	69	70	71	72	73	74	75	76	77	78	79	80	81	82	82A	82B	82C	83	84	85	86	87	88	89	90	91	92	93	94	95	96	97	98	99	100	100A	100B	100C	101	102	103	104	105	106	107	108	109	110	111	112	113
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Light chain

Position	1	2	3	4	5	6	7	8	9	10	11	12	13	14	15	16	17	18	19	20	21	22	23	24	25	26	27	28	29	30	30A	30B	30C	30D	31	32	33	34	35	36	37	38	39	40	41	42	43	44	45	46	47	48	49	50	51	52	53	54	55	56	57	58	59	60	61	62	63	64	65	66	67	68	69	70	71	72	73	74	75	76	77	78	79	80	81	82	83	84	85	86	87	88	89	90	91	92	93	94	95	96	97	98	99	100	101	102	103	104	105	106	107
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> SAbPred Links

Follow these links to our prediction tools:

Model the variable domain structure with ABodyBuilder
Test for possible therapeutic developability issues with TAP
Assign canonical forms by sequence with SCALOP
Number the sequences in any numbering scheme with ANARCI: [heavy] [light]

> Metadata

Format	Whole mAb ADC
Isotype	G1
Highest Clinical Trial (August '23)	Phase-II
Estimated Status (August '23)	Active
Recorded Developmental Technology	Humanised
INN Year Proposed	2022
INN Year Recommended	None
Companies Involved	Fudan University
Conditions Approved	na
Conditions Active	Solid cancers, Breast cancer
Conditions Discontinued	na
Notes	Anvatabart has an identical V domain to Coprelotamab, Cinrebafusp, Timigutuzumab, and Trastuzumab

Thera-SAbDab

ANVATABART